王作荣卸任“监察院长”职务后，曾低调前往大陆访问，并形容大陆是一个升起的太阳，主张台湾经济要有出路，应与大陆经济合流，两岸成一个经济体，但此倡议未被扁政府所采纳。
中国时报报道，王作荣在1999年出版自传《壮志未酬》一书有关台湾前途一章，就曾分析不论中国走向美国式的联邦制还是欧盟方式，台湾都不应缺席；他提及“中国走向美国联邦制，而台湾成为联邦的一份子，对台湾最有利”。
两千年政党轮替后，王作荣出席一场两岸关系圆桌论坛也断言两岸一定会统一，而且有95%机会“和平统一”，因为美国和中共都不愿打仗。
王作荣当时曾大胆预测，“只要大陆内部不发生政治动乱，未来的10到20年，大陆经济力量也超越台湾。”如今证明此一预测精准无比。
王作荣当时建议，台湾应大胆的和大陆展开谈判，除WTO规范外，两岸也应订出经贸往来的游戏规则。而如今两岸已签订ECFA等多项协议，代表两岸经济逐渐走向整合的大趋势。
2008年马政府上台后，王作荣再度投书建议马英九，“参照香港、美国联邦、欧盟、俄国加盟国模式，拟订一可行之模式与大陆进行秘密谈判。”
“统一已是大势所趋，问题只在何时以何种方式统一而已，而统一对台湾绝对有利”，王作荣如此建议马政府，这也代表他数十年来如一日的两岸主张。
